天啊我真的很需要一个字幕!!

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pdf:​​​​​​The R-fMRI Course | The R-fMRI Network

目录

1. DPABI输出文件

1.1. mat类文件

1.2. Img类文件

1.3. 其他类

2. 可再现性

2.1. 简介

2.2. 材料和方法

2.3. 结果

2.4. 讨论

1. DPABI输出文件

1.1. mat类文件

(1)

 

1.2. Img类文件

(1)FunRaw→生成FunImg一系列的(通过后缀分辨)

(2)T1Raw→生成T1Img一系列的(也有一堆有后缀的文件)

1.3. 其他类

(1)RealignParameter:做头动矫正生成的

        ①里面有被排除的文档记录

        ②生成的mean.nii为矫正后的脑影像图,wmean.nii为配准到标准空间的影像

        ③rp开头的文档记录头动参数

(2)ReorientMats:动态调整

        ①功能像调整.mat

        ②结构像调整.mat

(3)QC:在做reorient时的QC打分

(4)SymmetricGroupT1MeanTemplate:所有被试平均的T1影像

(5)结果Results和ResultsS。ResultsS就是相比Results做了一个Smooth(ALFF可以平滑,但是ReHo最好不要平滑)

2. 可再现性

2.1. 简介

(1)大脑有4w多个Voxel,因此假设检验要做四万多次(再次提到了多重比较矫正,但是上次已经统计过了,故这里不再赘述)

(2)置换检验(Permutation Test)

可参考:一张图,足够学会Permutation test置换检验 - 知乎 (zhihu.com)

(3)Thresholds卡得过严会导致可重复性变差

 

(4)神经科学的小样本

 

 小样本节省金钱和时间,并且多重比较的问题不会很严重

2.2. 材料和方法

(1)数据集

        ①Consortium for Reliability and Reprodudcibility(CORR):会扫两次,第一天扫一次隔几天再扫一次

        ②1000 Functional Connectomes Project(FCP):只扫一次

        ③Beijing EOEC1

        ④Beijing EOEC2

(2)统计流程

 

(3)Nuisance Regression:去除白质脑脊液信号对灰质信号的影响

 

 (4)R-fMRI指标

 

(5)多重比较矫正策略

 

(6)不同阈值下的假阳性值

 

(7)可信度/可复现性检验

 

(8)样本量增大的影响

 

 

(9)阳性预测值(positive predictive value,PPV)

 

2.3. 结果

(1)根据自己做出来的东西分析就好了,视频中的PPT我就不截图了

2.4. 讨论

(1)主要发现

 

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